Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lamc3Q9R0B6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc3Q9R0B6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Lamc3Q9R0B6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms