Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp1Q9R060 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms