Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp11cQ9QZW0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms