Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six6Q9QZ28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms