Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndrg3Q9QYF9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms