Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdh11Q9QYF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh11Q9QYF1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms