Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VapbQ9QY76 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms