Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp1Q9QY53 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp1Q9QY53 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms