Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn4Q9QXZ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Opn4Q9QXZ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Opn4Q9QXZ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Opn4Q9QXZ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Opn4Q9QXZ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Opn4Q9QXZ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms