Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx8Q9QXV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms