Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg2Q9QXK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms