Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChmQ9QXG2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChmQ9QXG2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms