Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Limd1Q9QXD8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Limd1Q9QXD8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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