Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dpf1Q9QX66 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dpf1Q9QX66 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms