Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rai2Q9QVY8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rai2Q9QVY8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms