Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms