Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMJ2

Fbxw4, F-box/WD repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw4Q9JMJ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxw4Q9JMJ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxw4Q9JMJ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms