Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf19Q9JLL3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf19Q9JLL3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms