Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp2Q9JLK4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp2Q9JLK4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp2Q9JLK4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms