Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms