Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TefQ9JLC6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefQ9JLC6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefQ9JLC6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms