Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CubnQ9JLB4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CubnQ9JLB4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms