Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms