Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Upk3aQ9JKX8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk3aQ9JKX8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms