Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp4Q9JKV5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scamp4Q9JKV5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms