Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx5Q9JKQ4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms