Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms