Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms