Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx3Q9JKB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms