Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msgn1Q9JK54 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms