Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpf2Q9JJ80 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpf2Q9JJ80 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms