Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad9Q9JIW5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms