Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbr1Q9JIT0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms