Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cacna1fQ9JIS7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1fQ9JIS7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms