Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sv2aQ9JIS5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sv2aQ9JIS5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms