Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb1Q9JIF7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb1Q9JIF7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms