Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms