Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EefsecQ9JHW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EefsecQ9JHW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms