Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RabggtaQ9JHK4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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