Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp29Q9ES63 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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