Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hipk3Q9ERH7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms