Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dap3Q9ER88 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms