Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn2Q9ER65 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms