Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Barx1Q9ER42 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Barx1Q9ER42 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms