Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp1bQ9EPL6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp1bQ9EPL6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms