Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn1Q9EPL2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms