Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms