Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms