Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms