Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop7Q9DCH2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms